כשמפעילים את שרת Version Cue בפעם הראשונה, Version Cue יוצרת אוטומטית שם משתמש של ברירת המחדל (system) עם זכויות של מנהל מערכת, ומבקשת לציין סיסמה. שם משתמש וסיסמה אלה מאפשרים להיכנס ל- Version Cue Server Administration.
גם משתמשים אחרים עם זכויות של מנהל מערכת יכולים להיכנס ל- Version Cue Server Administration.
(Windows) לחצו לחיצה ימנית על הסמל Version Cue בשורת המשימות ובחרו 'ניהול שרת'.
(Mac OS) לחצו על הסמל Version Cue בראש המסך, ולחצו על 'ניהול שרת'.
ניתן להיכנס ל- Version Cue Server Administration גם מ- Acrobat, Flash, InCopy, InDesign, Illustrator ו- Photoshop.