פרוייקטים של Version Cue מאוחסנים בשרתי Version Cue. פרוייקטים מאחסנים עותקי אב של קבצים שנוספו לפרוייקט, וכן גרסאות קובץ ונתוני קובץ אחרים, כגון הערות ותאריכי גרסאות. כששרת Version Cue Server מוגדר כגלוי ומתבצע שיתוף בפרוייקטים, משתמשים מרובים יכולים לגשת לפרוייקטים, היכולים לכלול קבצים של Adobe וקבצים שאינם קבצים של Adobe.
כשתפתחו בפעם הראשונה פרוייקט של Version Cue, Version Cue תיצור תיקייה בשם “Version Cue” בתיקיית 'המסמכים שלי' (Windows) או 'מסמכים' (Mac OS), ותוסיף תיקיית פרוייקט לתיקיית Version Cue. Version Cue גם יוצרת קיצור דרך לפרוייקט המופיע ב- Bridge ובתיבת הדו-שיח של Adobe לאחר שלוחצים על סמל Version Cue בחלונית 'מועדפים'.
ניתן ליצור ולנהל פרוייקטים רק אם הקציתם הרשאות מתאימות ב- Version Cue Server Administration.