Version Cue プロジェクトは Version Cue サーバに保存されます。 プロジェクトには、プロジェクトに追加されるファイルのマスターコピーのほか、ファイルバージョン、コメントやバージョンの日付などの他のファイルデータが保存されます。 Version Cue サーバが公開されるよう指定されてプロジェクトが共有されると、複数のユーザがプロジェクトにアクセスできます。プロジェクトにはアドビファイルもアドビ以外のファイルも格納できます。

Version Cue のプロジェクトを初めて開くと、Version Cue によって「Version Cue」というフォルダがマイドキュメント（Windows）または書類（Macintosh）フォルダに作成され、その Version Cue フォルダにプロジェクトフォルダが追加されます。 また、Version Cue のお気に入りアイコンをクリックすると、Version Cue によって Bridge および Adobe ダイアログボックスに表示されるプロジェクトにショートカットが作成されます。

プロジェクトの作成と管理を行うことができるのは、Version Cue サーバ管理でユーザに適切な権限が与えられている場合のみです。