Version Cue-prosjekter lagres på Version Cue-servere. Prosjektene innholder hovedkopiene av filene som legges til prosjektet, samt filversjoner og andre fildata, for eksempel kommentarer og versjonsdatoer. Når det er angitt at Version Cue-serveren skal være synlig og prosjektene er delte, kan flere brukere arbeide med prosjektene, som kan inneholde både Adobe-filer og filer som ikke er opprettet i Adobe-programmer.

Første gang du åpner et Version Cue-prosjekt, opprettes det en mappe som heter Version Cue, i mappen Mine dokumenter (Windows) eller Dokumenter (Mac OS), og det opprettes en mappe for prosjektet i Version Cue-mappen. Version Cue oppretter også en snarvei til prosjektet som vises i Bridge og i Adobe-dialogboksen etter at du har klikket på Version Cue-ikonet.

Du kan bare opprette og administrere prosjekter hvis du er tilordnet de nødvendige tillatelsene i Administrasjon av Version Cue CS3-server.